O programa de formação inclui cursos de formação inicial e continuada para professores indígenas que lecionam em escolas situadas nos seguintes municípios da região do Alto Solimões, Estado do Amazonas:
Em Assembléia realizada em 1993 - que reuniu 158 professores e lideranças ticunas - discutiu-se a necessidade de criar condições para dar seguimento aos estudos dos docentes ticunas, já que na época não havia na região oferta de cursos pelos órgãos governamentais. Por decisão desta mesma Assembléia, foi criado um curso de nível médio, a ser realizado em etapas e durante as férias escolares.
Inicialmente a OGPTB promoveu um curso de nível fundamental, sendo as primeiras etapas realizadas em parceria com o Magüta: Centro de Documentação e Pesquisa do Alto Solimões e a Universidade Federal do Amazonas.
Um total de 212 professores concluiu essa fase de estudos em 1996.
Em 1997, a OGPTB iniciou a formação de nível médio, no qual se formaram 204 professores ticunas entre 2001 e 2002. Devido ao crescimento da população de alunos e da necessidade de ampliação do quadro docente nas escolas ticunas, nesse período outros 29 alunos completaram o Ensino Fundamental e foi criada uma nova turma de Ensino Médio, inicialmente com 127 cursistas, aumentando para 141 em 2006.
Os cursos tiveram autorização do Conselho Estadual de Educação, através das Resoluções 51/97, 140/00 e 077/01.
A idéia central dos cursos é formar professores que contribuam para a construção de uma escola diferenciada e gerida pelos próprios indígenas, adotando um currículo intercultural que dê prioridade ao estudo e à valorização da língua materna e da cultura, às questões referentes à terra, meio ambiente, saúde, direitos, assim como outros temas identificados pelos professores e suas comunidades.
Os cursos têm ainda como objetivo oferecer aos professores indígenas os instrumentos necessários para poderem identificar problemas e buscar soluções criativas e inovadoras, fortalecer-se nos aspectos políticos e pedagógicos, e preparar-se para reinterpretar e atualizar, permanentemente, as funções de sua escola.
Em 2001, a OGPTB deu início aos cursos de formação continuada, visando aprofundar questões metodológicas e de planejamento, o estudo da legislação referente à educação indígena, assim como aperfeiçoar conhecimentos de língua portuguesa e de escrita da língua ticuna. Os cursos foram abertos aos novos professores que freqüentaram o Ensino Médio em escolas da cidade. Nesse caso, a formação continuada concentrou-se nos aspectos específicos do magistério indígena, orientada para a compreensão e desenvolvimento de uma educação bilíngüe e intercultural.
A partir de 2002, os cursos da OGPTB começaram a receber professores kokámas e caixanas, e o município de Tonantins passou a integrar o programa de formação.
Equipe de professores/consultores: as aulas e a orientação pedagógica dos cursos contaram com profissionais procedentes de universidades e outras instituições de ensino e pesquisa, com larga experiência em educação escolar indígena ou em projetos educacionais inovadores.
Coordenação geral dos cursos: Jussara Gomes Gruber (de 1993 a 2006)
Coordenação do Curso de Ensino Médio (2ª. turma): Maria Carlota de Lima Novaes (de novembro a dezembro de 2006).